Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms