Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm20795J3QP49 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm20795J3QP49 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm20795J3QP49 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm20795J3QP49 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm20795J3QP49 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm20795J3QP49 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20795J3QP49 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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