Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc180J3QNE4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc180J3QNE4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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