Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lipo1J3QME6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms