Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm6176J3QK59 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm6176J3QK59 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm6176J3QK59 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm6176J3QK59 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm6176J3QK59 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm6176J3QK59 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm6176J3QK59 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6176J3QK59 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm6176J3QK59 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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