Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20830J3KML6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms