Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20828J3KMI7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms