Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sclt1G5E861 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sclt1G5E861 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sclt1G5E861 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sclt1G5E861 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sclt1G5E861 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sclt1G5E861 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sclt1G5E861 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sclt1G5E861 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sclt1G5E861 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms