Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9yF8VPU6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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