Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Gm28048F7BCN0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm28048F7BCN0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm28048F7BCN0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm28048F7BCN0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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