Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gm10378F6XQQ1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10378F6XQQ1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms