Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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