Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm340F6RGI3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm340F6RGI3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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