Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fndc1E9Q043 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fndc1E9Q043 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms