Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcom1E9PZ54 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcom1E9PZ54 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms