Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rsph10bE9PYQ0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms