Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3298E9PW80 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms