Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms