Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samd1D3YXK1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Samd1D3YXK1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms