Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rfx8D3YU81 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rfx8D3YU81 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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