Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phf11bB4XVQ1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf11bB4XVQ1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms