Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf11cB4XVP9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms