Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cspp1B2RX88 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms