Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Usf3B2RUQ2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usf3B2RUQ2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Usf3B2RUQ2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usf3B2RUQ2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms