Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brpf1B2RRD7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms