Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms