Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf3B2KF05 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms