Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb8B1AY40 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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