Protein–RNA interactions for Protein: B1AVN5

Zfp990, Zinc finger protein 990, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp990B1AVN5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp990B1AVN5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms