Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pramef20B1ARV6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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