Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prr16A3KMN5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr16A3KMN5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms