Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf2A3KGV1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms