Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palm3A2TJV2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palm3A2TJV2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms