Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms