Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a3A2ACT7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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