Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprfA2A8L5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PtprfA2A8L5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PtprfA2A8L5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PtprfA2A8L5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprfA2A8L5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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