Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn8Q9Z260 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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