Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uso1Q9Z1Z0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms