Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3b1Q9Z1T1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms