Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms