Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn13Q9Z0S4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn13Q9Z0S4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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