Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms