Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema6cQ9WTM3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms