Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamc3Q9R0B6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms