Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AmfrQ9R049 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms