Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col4a3Q9QZS0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col4a3Q9QZS0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms