Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk3Q9QZL0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms