Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ercc4Q9QZD4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms