Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn8Q9QZ49 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms