Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt3Q9QZ47 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms